胃肠道间质瘤是一种介于良性和恶性之间的肿瘤，目前观点认为没有绝对的良性，只是发展潜能不同，因此临床医生是通过综合评估肿瘤部位、大小、可否切除，以及是否有远处转移等因素，决定是否需要手术。

如果胃肠道间质瘤的直径<2cm，医生判定危险性很低，不需要立即手术，只需要规律的去随访观察。如果危险性很高，需要采取手术干预。对于原发局限没有扩散可切除的胃肠道间质瘤，也要采取手术治疗。对于≥2cm的胃肠道间质瘤，需要手术切除，术后还需要根据危险度分级决定是否需要接受靶向治疗。

通常医生根据胃肠道间质瘤的大小、核分裂象计数、胃肠道间质瘤原发位置，判定胃肠道间质瘤的复发风险，主要分为极低危、低危、中危和高危四个风险等级。对于中危和高危等级的胃肠道间质瘤，复发风险较大，手术后还需要配合靶向的药物治疗，具体情况会根据临床情况作为具体指导。