过敏性结膜炎目前临床上常用的查过敏原方法是针刺法，也就是用针将过敏原一个个通过针刺进入真皮下，之后表现为小丘泡，来看是否能引起机体的过敏反应，来判断是否是过敏原。
过敏性结膜炎在临床上并不是很建议查过敏原，除非非常严重的情况下，会进行过敏原检查。因为要进行过敏原检查，就需要在机体皮肤表面扎几十个，甚至上百个点，比如尘螨是一个过敏原点，鸡蛋是一个过敏原点，或者是某种青菜是过敏原点，因此，有可能会漏掉大部分的过敏原。
针刺试验只可能检查机体是否对某些物质过敏，检查内容有限。在临床上，过敏性结膜炎常见的过敏原是尘螨、蛋白类食物、外界植物，比如漆树叶子，主要还是尘螨，以及空气中的污染物，例如PM2.5。而过敏性结膜炎与过敏性鼻炎经常一起发生，经常由过敏性鼻炎引起过敏性结膜炎。
