丝状角膜炎形成的病因较为复杂，发病机理尚未明确，主要由于病毒感染或者免疫力异常，同时见于眼表的部分疾病，如角膜移植术后的干眼，干眼包括有干燥性综合征、Siogren综合征这类疾病。丝状角膜炎病理生理的主要变化，包括上角膜上皮细胞异常增殖及角膜上皮细胞与前弹力层，即上皮细胞分泌均质膜的黏合力不足，还包括黏液形成过多。

在临床上可见丝状角膜上皮细胞异常增殖，由于丝状组织与角膜上皮相连，通常需要将丝状黏连物清除，局部再使用免疫抑制剂。治疗通常通过环孢霉素A联合使用眼表修复剂，或者碱性成纤维细胞生长因子，促进角膜上皮细胞愈合。