扁桃体摘除的最佳时间并不固定，需考虑手术适应症以及手术禁忌症。扁桃体是人类的免疫器官，对儿童尤为重要，故4岁以下的小儿进行扁桃体摘除手术需慎重。进行手术之前需考虑手术适应症和禁忌症，适应症包括扁桃体炎反复发作、存在扁桃体周围脓肿。如果扁桃体炎发作较为频繁，1年超过3次以上，尤其连续几年出现此种情况，可考虑进行扁桃体摘除手术。此外，若扁桃体出现肿瘤，也可考虑切除扁桃体，而其禁忌症如下：

1、存在急性炎症时不建议进行手术，通常在炎症控制2-3周后考虑手术；

2、病人出现凝血机制障碍，或存在再障等血液系统疾病时也不建议手术；

3、女性月经期前后不建议手术，因术后、术中出血较多；

4、免疫功能低下，酌情考虑、慎重手术；

5、存在较为严重的基础疾病，如血糖较高且控制不理想，或血压控制不理想，或存在肾病、肾炎、风湿性心脏病，需慎重考虑是否进行手术。

如果进行扁桃体摘除手术，若明确手术适应症、禁忌症，无需规定时间，春夏秋冬均可进行，但如果处于较大传染病流行期间，除非存在特殊情况，不然应尽量避免进行该手术。