舌根囊肿是囊性的胞质，为良性的肿块。舌根小囊肿通常无需处理，或只剔除囊肿就可以有较好的治疗效果。舌根癌是恶性的肿瘤，舌根癌分为舌根的高分化鳞癌、中分化鳞癌、低分化鳞癌、未分化鳞癌。恶性程度高的未分化鳞癌，手术效果也较差，对放疗也不敏感。低分化鳞癌可以进行放疗，也可以经过手术治疗，手术加放疗是低分化鳞癌的标准治疗方式。

所以，舌根鳞癌和舌根囊肿有本质区别，处理方式和手段也完全不同，一旦诊断舌根鳞癌，必须积极行早期手术切除。