因为肠镜和胃镜是侵入性操作，需要进到人体之内，一般都会有不适感：
1、胃镜：主要是恶心，或者患者觉得呼吸困难，呼吸不畅；
2、肠镜：主要是腹痛，因为人的肠道在腹腔里是弯曲的，肠镜进去之后会引起肠道牵拉，导致腹痛。但检查结束之后，腹痛很快消失。
如果患者不能耐受或者不愿意接受痛苦，可以做无痛苦的胃镜和肠镜，麻醉师会给予麻醉药，包括镇痛药，患者麻醉之后相当于入睡，进而在过程中无任何不适感。做完后给患者的感觉如同一觉睡醒之后，检查就结束了，尤其对于平时睡眠较差的患者。所以现在越来越多的患者，选择做无痛苦胃镜。普通胃镜和肠镜目前做的越来越少，这也是一种趋势，包括很多其它的检查和治疗也都在选择无痛苦的。患者做完无痛苦胃肠镜之后，无任何不适感，也没有任何不良反应。患者不用担心，做无痛苦的胃肠镜不会对大脑有影响，亦不会引起以后的智力受限。