在临床上经常可以见到扁桃体乳头状瘤，其确切病因尚未明了，可能与病毒感染有关，在机体免疫力下降的情况下感染乳头状瘤病毒而导致。比较小或比较早期的扁桃体乳头状瘤患者，多无明显自觉症状，常于张口或者查体时无意发现，表现为扁桃体表面单个或多个局限性隆起，表面凹凸不平，与扁桃体组织界限清晰。有的乳头状瘤范围较大，基体较广，有的属于多发性，患者可以出现临床症状，比如感到咽部不适、咳嗽 、异物感等，检查会发现扁桃体表面局限性隆起，单发或多发。

扁桃体乳头状瘤一旦被确诊，应考虑手术治疗，并配合口服抗病毒药物，如四季抗病毒口服液、利巴韦林等。手术方式可以单纯行乳头状瘤摘除，也可以连同扁桃体一同摘除。近期研究表明，微波、激光，以及等离子治疗扁桃体乳头状瘤临床效果显著，可以有效避免乳头状瘤复发。