目前膀胱结石基本上都是采取腔镜微创治疗，不是过去传统开刀手术，即经过尿道、膀胱镜经气压弹道碎石或者钬激光碎石，然后将打碎的结石冲出来。术后通过多饮水，必要时服用抗生素预防尿路感染。原发性的膀胱结石往往都有继发性的原因，同时需要处理继发原因。如果前列腺增生需要进行前列腺电切术，尿道狭窄需要狭窄内切开或狭窄切除吻合术，否则患者排尿不净，结石很快复发，临床上有很多这样的例子。

如果结石非常大、非常硬，不能够采取微创的方法进行治疗，也可能需要开刀手术，需要切开膀胱把结石取出来，把膀胱腹壁再缝合上，可能术后的住院时间稍微长一些。术后需要插尿管，尿管一般在1周以后才能拔除，插尿管期间要注意护理、清洁，尿道口要消毒，避免泌尿系感染。微创手术的方法术后不插尿管，或者插1天即可，创伤更小、恢复更快。