间质性肺疾病是较复杂的疾病，临床诊断间质性肺疾病需根据患者病史、临床症状、影像学检查，结合HRCT，以及肺功能检查，综合判断是否为肺部间质性疾病，明确诊断需根据肺活检。随着介入呼吸病学的发展，通过介入的方法也能达到诊断目的，如冷冻肺活检，冷冻肺活检指将冷冻探头放入病变较明显的部位，取组织做病理检查，观察间质性疾病类型，明确诊断。
临床在诊断间质性肺疾病需考虑有无易感因素，如接触职业性因素、粉尘、煤矽肺；是否使用过治疗纤维化药物；有无风湿性免疫性疾病，如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮引起相应的风湿性全身性疾病，而导致肺部间质性肺疾病。注意通过高分辨CT观察有无磨玻璃影、纤维化、蜂窝肺等CT表现。观察肺功能有无弥散下降，是否引起明显的弥散功能障碍，最重要的诊断标准为病理肺活检。
