食道黏膜损伤主要由于反流造成，患者可出现反酸、烧心或上腹部及胸骨后疼痛。此外，进食过烫、过硬或粗糙食物后，患者也可出现上述不适症状。

部分患者神经敏感性较差，出现较重炎症时症状不明显；部分患者食管处于高敏感状态，出现轻微反流时即可出现症状；部分患者的食管症状与损伤无关，称为功能性胃肠病或功能性烧心、功能性胸痛，此类患者未受到任何外界强刺激以及并无肉眼可见的损伤，即可出现相关症状。