颅底凹陷一部分患者无症状，则不严重。而有一类患者进展较慢，症状较轻，治疗效果也好，所以也不严重。但极少数病人确实严重，因其直接压迫脑干、延髓，延髓是呼吸生命中枢，所以严重的病人生活无法自理，需卧床，除四肢瘫外，可出现呼吸费力、吞咽功能不佳、咳嗽反射减弱等症状，较易误吸，所以会有生命危险，一定要重视。

若怀疑颅底陷入时，如出生后发现孩子脖子较短，和其他孩子有区别或颈部歪，肩膀一侧高一侧低，应及早到医院诊断，该病越早干预越好。