3天不排精阴茎根部很难受，可能有两个原因，可能是炎症，也有可能是心理问题。

1、炎症：阴茎根部难受和排精相关的疾病，主要是生殖道的炎症，生殖道有炎症，不排精就容易出现局部的炎症加重。规律性生活是减轻前列腺炎症最主要的一个辅助治疗方法，如果很年轻，3天排1次精，局部前列腺的炎症就会减轻。排精以后，会阴部不适、阴茎根部的疼痛症状都会减轻；

2、心理问题：如果没有炎症，不排精也难受，有一部分人可能是心理问题，一排精以后，精神愉悦，心情非常好，不排精可能局部非常难受，心里不舒服，这种情况可能与心理因素有关。