CT是X线断层成像的简称，MR是核磁共振成像的简称，CT和MR的区别主要有以下几个方面：

一、成像原理不同：

1、CT基于X线成像原理基础是根据不同组织，对X线的吸收率和透过度都不同，通过高灵敏的设备进行检测，并将检测的结果，输入到计算机进行重建，便能够得到所检测部位的，CT的横轴位图像或立体的图像，有辐射；

2、磁共振成像利用的是人体内本身存在的氢原子核，原理是通过测量氢原子核在强磁场下发生共振，在共振的过程中的一些信息，也通过后续的重建，得到的磁共振图像，没有辐射。

二、应用的范围或临床应用的优势不同：

1、CT检查在临床应用中，优势部位主要是胸部，尤其是肺，还有一些空腔脏器，包括胃肠道、骨骼等；

2、磁共振的优势，是软组织分辨率比较高，所以磁共振在临床应用中，主要是应用中枢神经系统，包括脑和脊髓，还有关节、韧带、软组织，另外在一些实质脏器，包括肝、胆、脾、胰、肾，男性、女性的生殖系统等，磁共振检查均优于CT检查。

三、禁忌证不同：

1、CT的禁忌证主要是碍于CT的射线和CT所用的造影剂，所以碘过敏的不能用，还有一些严重的肾功能衰竭，包括严重的甲亢、孕妇，这些均为CT检查的禁忌证；

2、磁共振检查的禁忌证主要包括体内有金属的，包括心脏的支架、起搏器、体内的钢板等。另外还有幽闭恐惧症，早期怀孕的孕妇磁共振检查能避免要尽量避免，但是如果孕妇一定要进行影像学检查，CT与核磁共振之间会选择磁共振检查。