服用抗甲亢药物不会影响月经，但甲亢的患者常合并月经紊乱。所以导致患者出现月经紊乱的原因并非服用抗甲亢的药物，而是由于甲状腺激素分泌增加所导致，表现为停经或月经量过少。

抗甲亢药物主要的不良反应是可能会导致白细胞下降或肝功能指标增加，所以对于服用抗甲亢药物的患者，在定期监测甲功的同时也要检查血常规以及肝功能。若查血常规显示白细胞下降、肝功能指标升高，则患者服用抗甲亢药物的剂量需减半。若患者出现明显的白细胞下降以及严重的肝功能指标升高，则需停用抗甲亢药物。甲亢的患者可以出现月经紊乱，但当患者的甲功恢复正常后，月经也可以恢复正常。