脑干胶质瘤的起源并未完全明确，主要原因是内部基因突变，或外在原因所致，外在原因举例如下：
1、与生活的环境、接触的大气污染有直接关系；
2、食物里面有很多化学毒物，可以促进内在基因发生突变；
3、空气污染、接触电离辐射或者放射性污染都可以促使原来不稳定的基因发生突变，进而发生胶质瘤。
脑干胶质瘤是原发于脑干的一种胶质瘤，占儿童整个脑肿瘤的10%-20%，所以最常见于儿童，由于发生在脑干，而脑干是人的生命中枢，所以手术切除的机会较少。外科医生获得活检和病理诊断后，对于脑干胶质瘤主要治疗方法是放疗和化疗。