体温恢复正常的基础，是能够针对疾病的病因进行治疗，故高烧39℃时应首先明确引起高热的原因。高烧39℃的病因主要包括流感病毒和呼吸道感染引起，以及一些非感染性疾病。但若高热39℃不能明确病因，且经过初步处理后亦没有使体温恢复正常，需到医院做相关检查，进一步诊断才能得到有效治疗，具体引起高热的病因及处理方式如下：
1、流感病毒：需应用抗流感病毒的药物进行有效治疗，但此前应到医院通过进一步的诊断来明确是否由流感病毒所引起，如流感病毒的核酸检测为阳性时，则可应用奥司他韦等神经氨酸酶抑制剂，来抑制病毒的复制，且同时进行对症治疗及支持治疗；
2、呼吸道感染：包括上呼吸道和下呼吸道感染，下呼吸道感染如肺炎、肺脓肿等均可引起高热。若呼吸道感染为上呼吸道感染引起，可先进行退热治疗，即自行应用退热的药物先期进行退热处理以及多饮水来使体温下降，若体温不下降或体温下降后再升高，则需到医院做进一步的诊断。
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