目前治疗脑积水最主要手术方式是脑室-腹腔分流术，以前还有人从椎管采用分流术直接将积水分流到腹腔，但这种手术现在做得非常少。

脑积水手术方式也会带来并发症，因为是侵入性手术，可以引起颅内感染，甚至感染后可能造成脑积水引流管堵塞。由于是侵入性手术，可导致出血等并发症，感染或出血以后有可能会导致滞留管需要拔出，有可能脑积水要重新进行手术。