由于肾盂肿瘤通常为移行上皮肿瘤，存在种植转移的风险，其切除范围较大，包括整个肾脏、输尿管及部分膀胱。部分患者肿瘤恶性程度较高，需行肾上腺切除。肾盂肿瘤术后并发症类型相对较多。如果切除肾上腺，患者的肾上腺皮质功能受到抑制，易出现肾上腺皮质功能不全，导致心跳、呼吸加快，酸中毒、碱中毒等情况的发生，此时患者需进行适当的激素补充治疗。如果患者对侧肾脏功能不全，切除一侧肾脏后，短时间内会出现肾功能不全、尿少的情况，需行血液透析，观察判断患者肾功能进展变化情况。

输尿管走行区域较长，周围有丰富的血管、淋巴管及神经等。如果损伤血管，手术过程中易出现出血；如果损伤淋巴管，易导致乳糜瘘；损伤神经会出现疼痛的感觉。其次，肿瘤较大时，会在腹壁形成长约8㎝的切口，切口会出现感染、脂肪液化的情况。肥胖病人手术后切口易发生脂肪液化及感染，需要进一步处理切口。膀胱部分切除以后，缝合的位置易发生出血、感染的情况。