小脑萎缩从早期到晚期的发展过程中，早期若给予药物干预及功能锻炼，晚期时给予良好护理，整个过程可以持续20-30年。但发展至晚期后药物效果会减退、症状加重，患者可能出现吞咽困难、饮水呛咳、进行性智能下降，表现为记忆力、计算能力、言语能力的明显衰退，不能与人沟通，不能表达意思，所以在晚期时易出现并发症。

较常见的并发症为容易出现吞咽困难、饮水呛咳，出现误吸而导致窒息，甚至出现肺部感染、尿路感染、褥疮等，易引起死亡。晚期发生上述症状表现通常在2-3年内可能会致命，往往是因并发症引起严重后果。严重并发症还可表现为深静脉血栓形成、肺动脉栓塞，此种情况通常预后均较差，易引起生命危险，最后可能致命。晚期小脑萎缩患者，需做好护理，避免发生意外。