隐睾术后睾丸萎缩主要有以下几种可能性：

1、术中可能损伤睾丸动脉，睾丸供血差，导致隐睾术后睾丸出现萎缩；

2、隐睾固定处较紧，导致精索受到牵拉，引起动脉供血差，造成睾丸萎缩。该情况多见于高位隐睾下降固定时睾丸张力较高，导致萎缩；

3、隐睾自身问题，睾丸由于较长时间没有在阴囊内，特别是腹腔型高位隐睾，由于生存环境异常，发育异常。即使下降到阴囊，睾丸发育也已经受到障碍，因此术后远期复查可以出现萎缩。

因此，隐睾患儿及时手术干预较为重要。目前建议的手术时间为6-12个月，最晚不超过18个月。