宝宝在睡觉时摇头的原因如下：
1、皮肤疾病：头皮、颜面有过敏性皮炎或湿疹会产生明显的瘙痒感，宝宝就会出现摇头，甚至是抓挠，所以应当针对性地选择外涂药膏来抗过敏；
2、出汗：环境温度太高或衣物穿得太多导致宝宝出汗，出汗会刺激皮肤不舒服，从而出现摇头、抖动、睡眠不安等症状；
3、维生素D缺乏性佝偻病：缺乏维生素D会出现多汗、枕秃、夜间睡眠不安、容易夜惊和骨骼畸形等症状，建议进行血清的25-羟维生素D3测定，如果水平较低，建议及时补充维生素D，可以改善相关症状；
4、外伤：导致脑震荡或颅内出血，宝宝出现摇头、抖动，甚至是剧烈哭闹、精神状态差等症状，如果有外伤病史，应当及时到医院就诊并完善相关检查；
5、颅内疾病：出现颅内肿瘤，同时伴有发烧、精神萎靡，出现颅内感染时，宝宝会出现头晕、头痛、恶心、呕吐，甚至频繁摇头、抖动等，应当及时到医院检查以明确病因，从而进行针对性治疗。
