直肠炎的治疗方法可以通过口服药物，但是在临床上更多主要采用局部给药。局部给药因为药物能够直达病所，且直肠位于人体的下部。另外直肠给药还可以避过肝脏效应，不至于对肝脏造成比较大的损害，一般来讲可以采用局部给药。局部给药有两种基本的药物剂型：
1、栓剂治疗：如果炎症范围不是特别大，只是在直肠下段炎症，可以通过栓剂。栓剂能起到比较好的治疗作用，比如美沙拉秦栓在临床上对直肠炎有比较好治疗作用。还有治疗肛门部的太宁栓，也有黏膜保护作用，也对直肠炎症也有一定治疗作用；
2、灌肠治疗：灌肠后要尽量躺着，先暂时不要直立，过几个小时后，药物得有部分吸收，还有部分水分都吸收掉，这时再活动。如果刚灌进去，要活动，容易有便意感，保留不住药液，所以在临床上灌药以后要卧位待着。如果有乙状结肠的炎症，体位可以呈头低臀高位，这样让药液往乙状结肠流动，可能效果比较好。