甲状腺癌术后复发概率较低，甲状腺癌中乳头状癌与滤泡癌占到90％-95％，其余包括髓样癌、未分化癌、甲状腺淋巴瘤、鳞癌等，此类患者可能占5％-10％左右。相对预后较差，容易复发、转移。

甲状腺癌的复发与转移和肿瘤大小、肿瘤术前有无淋巴结或远处转移有很大关系，如果肿瘤存在术前淋巴结转移较多的情况，后期手术以后出现转移的概率高。此外，远处转移特别是滤泡癌，容易出现血行转移到达腹部、肺部、骨、脑等重要器官。