HPV阳性仍然推荐接种疫苗，因为疫苗接种者不太可能感染HPV疫苗所包含的型别，但仍可能感染疫苗包含的其它亚型。具体接种何种疫苗取决于年龄，中国大陆有二价HPV疫苗，适合9-45岁，四价HPV疫苗适合20-45岁，九价HPV疫苗适合16-26岁。
另外疫苗仅应用于预防，不应用于治疗，对于已发生HPV感染和相关病变者，并无治疗作用，也不能防止病变进展。接种疫苗不代表一劳永逸，还需进行常规的宫颈癌筛查。目前二价疫苗可预防HPV16和18两种病毒，四价疫苗可以预防四种类型的病毒，九价疫苗可预防九种病毒类型，是目前预防涵盖范围最广的疫苗，可以预防6、11、16、18、31、33、45、52、58亚型，是目前防护效果最全面的HPV疫苗。
