消化不良时因为胰腺、肠黏膜上皮，或者肝脏分泌消化酶量不足导致食物不能被充分分解，不能被充分吸收而积攒在肠道当中。没有被分解吸收的食物残渣会形成一定渗透压，特别是肠道存在一定敏感性增高情况下，运动也会加快。渗透压增高导致液体渗透入肠道，形成容积性增加，容积性增长会刺激肠道运动，造成腹泻情况，在临床上并不少见。

此外，一些功能性患者，比如比较容易生气经常会肚子疼，一肚子痛就想上厕所，或者一想上厕所就肚子痛，而排完便以后腹痛能够减轻，完全是由于消化产生了一定问题。