表皮样囊肿的祛除方法，首选手术，同时也是最推荐的治疗方法。如果患者明确诊断为表皮样囊肿，即可通过手术的方式祛除。该手术属于比较基本、简单的小手术，在就诊当日局麻手术后即可回家，但是该手术需将表皮样囊肿的囊壁完整的剥离和祛除，因为在手术中若未将囊壁祛除干净，术后一段时间内可能导致复发，所以囊壁是否祛除干净，直接关系到表皮样囊肿是否会复发的可能性。
在剥离囊壁时，如果早期的病变，没有反复发生感染的病变，手术比较简单，则囊壁与周围组织界限比较清楚，没有发生粘连，可以比较轻松的将囊壁剥离下来，但是如果囊肿已经多次发生感染，多次有脓肿、引流的病史，其囊壁已经遭到破坏，与周围组织的关系不明确，会给手术带来较大的麻烦，但是也务必将该位置的囊壁祛除干净，减少复发的可能性。
