新生儿房间隔缺损需要根据缺损类型选择合适的治疗方法，对于原发性房间隔缺损6mm且合并有其它心血管畸形的新生儿，需要通过外科手术进行干预；继发性房间隔缺损6mm的新生儿可以进行随访。房间隔缺损在3-8mm的新生儿在一岁半前有自行闭合的可能，在三岁前可以定期进行心脏彩超检查，观察患儿缺损是否有自行闭合的可能。如果三岁后仍没有闭合，可以选择介入治疗，同时要注意患儿情况；如果房间隔缺损出现临床症状，必须根据症状及时到正规医院进行治疗和救治。
单纯继发性房间隔缺损6mm的新生儿，可以在适当的时机选择介入治疗，在微创的情况下达到治疗目的，但如果是原发性房间隔缺损6mm，且合并有其它心血管畸形的新生儿，如二尖瓣的瓣裂，介入治疗无法达到治疗目的，必须选择开胸直视下的心脏手术。
