直肠癌放疗过程中肛门肿痛主要原因如下：

1、肛门软组织的水肿，放疗过程中局部的软组织水肿，导致肛门周围有肿胀、疼痛的感觉；

2、肛门周围皮肤较薄弱，在放疗过程中首先出现放射性皮肤反应，甚至部分患者出现肛周皮肤溃烂的情况。

这两方面的原因导致患者出现肛门周围不适、肿痛等主观症状，临床上较为常见，无需过度担心。经过对症处理，在放疗结束后1-2星期内，症状可以完全缓解。