新生儿哭闹时嘴唇发紫，主要原因如下：

1、生理性因素：新生儿哭闹时肺储备不足，影响通气与换气功能，机体一般情况较好，正常状态下无青紫表现，则不用特殊干预；

2、病理性因素：如轻型先天性心脏病，正常活动下不会发生青紫，肤色正常，但由于大声哭闹后，体循环改变引起青紫。应到医院行心脏彩超检查，待结果出来后到心脏外科进行评估，根据情况进行手术相关治疗。此外，肺脏疾病如先天性膈疝、先天性纵隔疝、先天性肺大疱、先天性肺隔离症等，可在新生儿哭闹后发生口唇青紫现象，需到儿科就诊，在儿科医生指导下进行查体以及相关检查。