胎儿系统超声筛查一般是在中孕期进行检查，一般是18-24周进行检查，系统筛查主要是大排畸检查，会系统的对神经系统、骨骼系统、消化系统等进行检查。

系统筛查的意义更重要的是排除致死性的危重畸形，以及卫生部规定的六大畸形，如无脑儿、严重的单腔心、严重的内脏外翻、严重的腹壁裂，但只是排除严重的致死畸形，而不是把所有的畸形都检查出来。