重症肌无力是一种自身免疫性疾病，主要是在神经肌肉接头处，治疗方法也是有很多，最常见的是因为85%以上的患者会合并胸腺瘤或胸腺增生，因此进行胸腺切除手术对于这类患者十分必要，绝大部分患者要进行，大部分患者经过胸腺切除术以后症状可以缓解。此外如果患者急性处于重症肌无力的活动期或急性发作，还可以采用免疫治疗的方法，目前常用的是大剂量激素冲击治疗。但要需要注意的是激素冲击可能会诱发患者肌无力。此外如果患者激素治疗症状不能缓解或不适用激素，可以选用其他方法，如血浆置换、静脉注射丙种球蛋白都是比较好的方法。此外还可以用免疫制剂像硫唑嘌呤、他克莫司、吗替麦考酚酯等，此外还可以选用重症肌无力的对症治疗，常用的是胆碱酯酶抑制剂如溴吡斯的明可以缓解患者症状，总之重症肌无力其实是可治性疾病。
