到目前为止，原发性胆汁肝硬化还没有诊断的金标准，也就是没有哪一个证据就证明是原发性胆汁性肝硬化。原发性胆汁性肝硬化要和几个疾病进行鉴别，如和自身免疫性肝炎、肝外胆管阻塞、原发性硬化性胆管炎进行鉴别，其在发病机制上有相同之处，也有不同之处。
怎么诊断原发性胆汁性肝硬化？首先患者是黄疸为主要表现，还有门脉高压的改变，表现为大出血、腹水、腹壁的静脉曲张等，患者还有胆汁淤积的表现，胆汁淤积以后有没有出现肝内外的大胆管的扩张。如果出现大的胆管扩张，要考虑是不是有原发性硬化性胆管炎的问题，或有肝外胆管梗阻的问题；一定要注意是小胆管的病变造成胆汁淤积。另外，患者要注意自身抗体谱检测，像抗平滑肌抗体、抗核抗体改变，专科医生需要做非常细致入微的鉴别诊断。
