总体来说，扁平疣是由于HPV病毒感染播散所致，通常与性生活并没有明显的相关性。主要是由于日常的摩擦、接触，或者是皮肤有创面，自然界的病毒在皮下进行定植，进而导致的一个传播行为，所以扁平疣与同房、性行为并没有明显的因果关系。

得了扁平疣以后，可以选择外用药物，比如氟尿嘧啶、咪喹莫特等。这些药物如果效果不理想，也可以到医院选择液氮冷冻或者二氧化碳激光进行去除处理。经过正规、积极的治疗，这个疾病还是可以快速的消退。

因此，对于扁平疣与夫妻同房的关系，并没有科学的研究结果可以证实，所以也不要担心。