颅骨修补手术一般手术时间是2-3个小时，包括手术麻醉时间、手术时间以及术后麻醉苏醒时间，可能需要3-4个小时。手术过程一般为进入手术室后对患者进行全身麻醉，观察生命体征平稳，沿原来切口进行消毒，进行手术铺单后沿原来手术切口打开，暴露缺损部位，分离皮瓣和脑组织后彻底暴露缺损部位。

而对于不同手术部位存在不同的手术时间，例如常见额颞缺损部位，由于分离颞肌和脑组织，手术时间相对较长。对于凸面颅骨缺损修补手术，因其不涉及颞肌及脑组织分离，手术时间相对较短，所以颅骨缺损修复手术时间因部位不同有所差异。