棘阿米巴角膜炎存在明确病原体，是由棘阿米巴原虫所造成的角膜炎。治疗需要及早发现棘阿米巴原虫，在潜伏期进行一系列检查，包括角膜刮片检查、角膜荧光显微镜检查、角膜接触镜和镜盒涂片培养。通过这些检查发现棘阿米巴原虫，即可确诊为棘阿米巴角膜炎，然后根据棘阿米巴角膜炎药物敏感性进行治疗。

棘阿米巴角膜炎此病多在配戴隐形眼镜或外伤后引起，早期出现角膜上皮糜烂、脱落和假树枝症状，患者畏光、流泪、疼痛明显，视力下降。后期向基质浸润，形成盘状角膜炎，造成前房积脓甚至角膜穿孔等严重并发症。