经皮肾镜是在腰部建立一条从皮肤至肾脏的通道，通过该通道将肾镜植入肾脏，利用激光、超声等碎石工具将肾结石击碎、取出的手术。经皮肾镜手术属于微创手术，但需要在肾脏取一个洞。如果有需要，可能需要输血，甚至需要进行介入栓塞止血治疗。部分肾结石比较复杂，需要进行多次经皮肾镜手术才可将结石取得比较干净。由于医院、手术难度以及术后恢复不同，经皮肾镜碎石手术的费用也不同，目前开展经皮肾镜碎石手术的费用大约为一万元。