肝病甲胎蛋白阳性提示血液中甲胎蛋白水平增高，常见于慢性肝炎、肝硬化，甚至是肝脏恶性肿瘤。甲胎蛋白显著升高是临床上诊断原发性肝癌的重要依据，多数人体检时会发现甲胎蛋白轻度升高，如果没有慢性肝病基础，通常不是肝癌引起，不必过于担心，可以定期检查。如果有慢性肝病，包括病毒性肝炎、严重脂肪肝、酒精性肝病，影像学检查提示肝上有结节或者占位，甲胎蛋白升高具有较重要临床意义。
如果超声无法确认结节具体性质，需做腹部增强CT或核磁明确诊断。甲胎蛋白水平越高，提示结节恶变风险越大。但不是所有肝癌均会出现甲胎蛋白升高，部分肝癌已经确诊，但是甲胎蛋白可显示正常。所以对于肝病，特别是肝脏肿瘤诊断，既要结合临床病史，还要结合肿瘤标志物，更主要是要通过影像学、病理学检查才能最终确诊。