慢性扁桃体炎和慢性咽炎的区别，主要有以下几方面：
1、发病部位：慢性扁桃体炎的主要病变部位是扁桃体，腭扁桃体较为常见。腭扁桃体位于口咽腔，左右各一，扁桃体隐窝内发炎主要为腭扁桃体的慢性炎症。而慢性咽炎的发病部位通常在咽部的黏膜，包括口咽部、鼻咽部以及下咽部的黏膜，主要病变部位在咽后壁以及咽侧壁，包括黏膜、黏膜下腺体以及黏膜下的淋巴组织等；
2、治疗方法：慢性扁桃体炎的主要治疗方法为药物治疗，也可采用手术治疗。通常慢性扁桃体炎在药物治疗无效以及急性扁桃体炎每年反复发作3次以上，同时伴有全身的合并症，比如心脏病或者血小板减小性紫癜以及肾炎等，则需要手术切除治疗。如果扁桃体伴随脓肿以及出现扁桃体周围炎，也需要进行手术切除。慢性咽炎的治疗通常为药物治疗，而且是局部药物治疗，包括雾化吸入治疗、喷雾剂治疗以及口含片、漱口水的治疗。
