经食管超声心动图虽然很安全，相对来说也算是放入人体内的检查，也有一定的适应症和禁忌症，在临床上大多数患者都没有问题，有一部分患者要注意：
1、如果患者食管有问题，比如食管狭窄、食管有溃疡，或者肿瘤病人做放疗化疗，这些病人就怕食管损伤，就不太适合做；
2、在做的过程当中会给病人使用黏膜麻醉，毕竟要放入食管里面，经过口腔、咽喉部到食道，这个过程有些患者会有不适的感觉，会局部黏膜麻醉，就会存在有些病人对局部黏膜麻醉剂过敏，过敏的患者也不适合做这项检查；
3、患者病情非常严重心功能很差、心衰、严重的心律失常，比如有室性心律失常，这类病人也轻易不要做这项检查，会加重病情，这些都是不适合做的。
所有病人肯定是先做无创最简单的经体表超声心动图，适合经食管超声心动的病人：
1、有一些患者比如比较肥胖，经体表超声做的时候，探头放在这儿声束要穿透皮肤、皮下脂肪层、肋骨、肺气、气管的干扰，如果患者胸壁比较厚、脂肪层很厚，图像显示不清楚或者存在肺部疾病遮挡心脏结构，体表超声根本都看不清楚，病人病情又特别需要做，就会选择做经食管的超声心动图；
2、疾病诊断要求超声非常精准的评价，比如感染性心内膜炎怀疑心腔内有赘生物，到底有或者没有，经体表超声心动图达不到要求看不清的时候，也会做经食管的超声心动图；
3、比较适合做经食管超声心动图的就是瓣膜疾病的诊断，包括自身瓣膜、置换之后的人工瓣膜、怀疑有主动脉夹层或者心腔内血栓的，尤其是房颤患者怀疑胸腔内有血栓；
4、在临床上用的非常普遍就是必须要有进食管超声，有一些介入手术操作、术中监护都需要超声心动图全程引导，尤其是最近1-2年开展的纯超声引导下介入手术的完成，都是需要经食管超声进行引导的，是必须要做的。