疱疹性咽峡炎主要是由柯萨奇病毒A4感染所引起，而柯萨奇病毒是一种肠病毒，一般分为A、B两类，人体比较常见，可以通过呼吸道和消化道感染人体，感染人体以后，可以出现发热、打喷嚏等感冒症状。

疱疹性咽峡炎主要是病损分布在口腔中的咽峡部，在口腔后部包括软腭、悬雍垂以及扁桃腺，出现了成簇的小水泡，而这些部位在吞咽或进食时进行摩擦，很快又可以形成溃疡。

疱疹性咽峡炎有自限性，只要没有继发感染，整个病程大约七天左右便可以自愈。