药物流产本身的安全性较高，药物流产主要是通过口服米非司酮和前列腺素，来终止停经49天之内的早期妊娠。米非司酮可以改变子宫内膜环境，使胚胎不容易发育或停止发育，还可使宫颈软化。再服用前列腺素，前列腺素可使子宫收缩，将胚胎排出体外。

药物流产成功率和患者的年龄有关，通常适用于18-40岁的女性，如果患者在40岁以上，药物流产的成功性较低，孕囊较大也会使得药物流产失败。药物流产有时会发生流产不干净的情况，需要做刮宫手术，有时也会出现药物流产失败的情况，需要再做人工流产手术。