先天性心脏病的筛查可以通过视、触、叩、听，即基本临床体格检查方法，视诊观察孩子面色、孩子发育情况、精神情况；触诊是触摸心前区心尖波动的范围强弱；叩诊可以看心脏浊音界大小，明确孩子心脏大小；听诊即可以通过心脏听诊发现心脏杂音或心脏强弱，有无心律失常。

此外，也可以做经皮氧饱和度，这是很重要的直接无创性检查方法，是先天性心脏病的筛查方法。