胃间质瘤其实是一种交界性的肿瘤，判断其良恶性可以分为以下两个方面：
1、肿瘤的大小：往往超过5cm以上的间质瘤，恶性的可能性更大一些；
2、将其切除后，送至病理检查，病理观察核分裂象，越多倾向于恶性，越少倾向于良性。
当早期发现了胃间质瘤的时候，存在手术指征，即胃间质瘤直径＞2cm，则应进行手术，2cm以下可进行观察。当其达到2cm左右的时候进行手术，这种情况往往术后病理报的就是倾向于良性的间质瘤，因此完全可以达到治愈。
当然，胃间质瘤在很小的时候往往难以发现，因为患者不出现症状通常不会到医院就诊。许多患者到医院就诊的时候，胃间质瘤往往已经长到3-4cm，甚至更大，这种时候术后病理往往提示这是一种恶性的胃间质瘤。但是即使是这样，随着现在技术手段的提高，在进行规范的手术之后，如果病理报的是高度怀疑恶性的间质瘤，仍然可以通过术后辅助的治疗达到治愈的效果。
