心房心肌病的治疗，主要是对病因的治疗和预防将来再发生心律失常的治疗。心房心肌病是因为心房本身有纤维化，或者是先天基因决定的，或者是后天因素造成的心房本身的疤痕，这种疤痕很难去除。所以不能根本治愈，也就是不能让心房变成完全正常的、健康的病理上正常的心房。需要做的就是减少心房心肌病引起的心律失常，减少心律失常引起的进一步的左心衰。

心房心肌病主要容易引起房颤，发生房颤之后，由于房颤的存在，会造成心动过速心肌病，然后造成左心室的心衰、左心室扩大、左心室变形、射血分数下降，从而出现心衰，对人危害非常大。所以心房心肌病如果发生心律失常、发生房颤，就需要去做射频消融把房颤治愈，减少心房心肌病引起的或房颤引起的心衰，以及栓塞性的疾病。

心房心肌病容易长血栓，特别是左心耳里面容易长血栓，所以要进行抗栓治疗。如果心房心肌病本身出现了心房的扩大，同时出现了房颤，除了做射频消融以外，还要长期的口服抗凝药来进行预防体循环栓塞，尤其是预防脑梗死的治疗，所以需要长期进行抗栓治疗、抗凝治疗。