做肠镜时从肠镜近端插入肛门口算起，依次通过直肠、乙状结肠，降结肠、横结肠、升结肠、盲肠，时间大约是6-7分钟左右，在熟练的情况下，然后退镜，退镜顺序是依次为盲肠、升结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠，直肠，时间段大约是5-10分钟左右。

如果是期间去活检或者是做治疗，时间会长，操作技术比较不太熟练的情况下，时间也会延长。