临床肿瘤标志物较多，其中最常应用甲胎蛋白，即AFP，和癌胚抗原，即CEA，糖类抗原CA12-5、CA15-3、CA19-9、CA72-4，和细胞角蛋白即CY211，以及鳞状细胞癌相关抗原SCC，神经元特异性烯醇化酶NSE，以及总前列腺特异抗原、游离前列腺特异抗原等。

肿瘤标志物是指在肿瘤发生和增殖过程中，由于肿瘤细胞本身合成或机体对肿瘤细胞反应产生的一类物质。肿瘤标志物对肿瘤普查、辅助诊断、疗效观察以及判断预后存在重要意义。