肝脏内会长结石，肝脏内有很多小胆管，肝脏产生的胆汁首先会排入小胆管，通过小胆管再流入大胆管，再通过肝总管排到胆总管，最后排入到肠道内参与人体的消化。所以任何造成胆汁排出不畅或胆汁成分改变的因素，比如胆管狭窄、胆道感染、高胆固醇饮食等，都有可能导致胆汁内的胆色素和胆固醇沉淀，在胆管内形成结石。

如果结石形成于肝内胆管，就是肝内胆管结石；如果结石形成于肝外胆管，则是肝外胆管结石。