肝胆管结石微创碎石主要是指胆道术后肝内胆管残余结石行胆道镜取石。不同级别医院，不同地区医院收费标准不同，通常3000-4000元左右。部分复杂型肝胆管结石患者因为各种原因无法行手术治疗，也可经脾、经肝胆道镜取石，一次约7000-8000元。不同地区、不同级别医院收费标准不一样，沿海比内陆收费稍高。

另外，肝胆管结石患者行手术治疗后，肝内胆管结石残留几率较高，部分结石较大，无法用胆道镜下取石网篮直接取出，需要用液电或者等离子碎石治疗，结石较多可能需要多次治疗。