幽门螺杆菌的检测方法较多，根据是否有创分为有创与无创，无创的分为侵入性与非侵入性。侵入性的检查是通过胃镜检查并取材，用取下的组织进行快速尿素酶试验、细菌培养及组织检查等。细菌培养比较繁琐，培养有一定的时间性，培养的难度也较大，一般耐药或者做研究时才会用细菌培养。在临床工作中尿素酶试验相对方便。常用的非侵入性检查就是呼气试验，可以做碳13及碳14标记的呼气试验。另外，还有粪便的抗原检测及血清学检测。

在临床工作中选用哪种检查方法来诊断是否有幽门螺杆菌感染，要根据患者的状态以及检查的目的来选择。幽门螺杆菌的碳13、碳14呼气试验在临床上用的较多，因为它简单、易行，复查也比较方便，尤其是很多患者在前期可能做过胃镜及呼气试验，知道胃里有幽门螺杆菌，经过治疗以后停药4周就可以再做呼气试验来判断是否根除成功，但是有些特殊患者不仅要做呼气试验来检测是否有幽门螺杆菌，同时可能还要复查胃镜来了解胃里的情况。