单纯病毒性脑膜炎因为是自限性疾病，不会引起后遗症。但是没有得到正确、正规治疗的病人病情会进展，会引起脑膜脑炎。病人脑膜方面有炎症，进一步发展后影响脑实质引起脑炎，遗留神经系统后遗症。实际上，老百姓口中的病毒性脑膜炎多指病毒性脑炎，病毒性脑炎是一种损害脑实质的颅内感染，严重者导致颅脑损伤。失治、误治或者治疗效果不佳会造成脑性瘫痪，即常说的脑瘫，或者造成严重痴呆、癫痫，甚至成为植物人，最严重的后果会危及生命。病毒性脑膜炎根据病毒种类不同，有多种病毒性脑炎，最常见的病毒性脑炎是单纯疱疹病毒性脑炎，即单疱脑炎，其次是带状疱疹、病毒性脑炎等。
